Во вселенной существует огромное множество миров, некоторые из которых контролируются достаточно амбициозными лидерами. Однако, последние не имеют право нападать на соседей, а за соблюдением баланса следят Высшие боги. Вдобавок, у каждой населенной планеты имеется собственный покровитель. Впрочем, один законный способ экспансии все же предусмотрен. Необходимо десять раз подряд победить в «Смертельной битве», на которую обороняющийся выставляет лучших бойцов. Престарелый колдун по имени Шан Цзун представляет интересы Внешнего мира. Он бросил вызов сила Земли, возглавляемых Рейденом. На стороне первого выступает принц-чемпион Горо, а второго монах шаолиньского монастыря Лю Кан. Предыдущие девять турниров люди проиграли, потому на кону стоит судьба всей цивилизации.
Компанию упомянутым ранее персонажам составляет актер боевиков Джонни Кейдж, полагающий, что его пригласили в очень оригинальный проект. Соня Блейд же присоединилась к данной группе в надежде отомстить Кано из криминального синдиката под названием «Черный Дракон». Непосредственно во время «Смертельной битвы» объявляется «Скорпион», заключивший сделку с некромантом из Царства Небытия, которого зовут Куан Чи. Последний даст возможность приспешнику сразиться с Саб-Зиро, в обмен на амулет павшего старшего божества Шиннока. Впрочем, Рейдену удается привести достойные аргументы, чтобы Скорпион отказался сотрудничать с колдуном.