В анимационном фильме "Мегамозг" рассказывается история инопланетянина с голубой кожей и гигантской головой, который с детства соперничает с другим пришельцем – Метро-Мэном. Пока Метро-Мэн стал величайшим героем города, Мегамозг превратился в его главного злодея, постоянно терпя поражения. Однако всё меняется, когда Мегамозгу неожиданно удаётся победить своего заклятого врага. После триумфа город оказывается в его руках, но вместо радости от победы, он ощущает пустоту – без достойного противника его злодейское существование теряет смысл.

Пытаясь вернуть прежнее равновесие, Мегамозг создаёт нового супергероя, но эксперимент идёт не по плану. Параллельно с этим он влюбляется в репортёра Роксану Ричи, ради которой начинает притворяться обычным человеком. Когда его созданный герой превращается в настоящего злодея, угрожающего городу и Роксане, Мегамозг оказывается перед сложным выбором. Возможно, тот, кого все считали злодеем, на самом деле способен стать героем и найти своё настоящее предназначение.