Центральное разведывательное управление проводило незаконный эксперимент в рамках проекта «Тредстоун», готовя особо опасных агентов, в том числе Джейсона Борна, вышедшего из-под контроля. У Министерства обороны была аналогичная программа под названием «Аутком». Вот только военные не останавливались на физических и ментальных тренировках, пичкая участников таблетками. Синие пилюли ускоряли работу мозга, а зелёные усиливали силовые характеристики. В процессе выяснилось, что стоит прервать прием препаратов, организм быстро деградирует и человек погибает. Кеннету Джеймсу Китсому пришлось сменить имя на Аарон Кросс, чтобы стать пятым членом команды «Аутком». При этом официально его считают погибшим в зоне боевых действий.
Когда Джейсону удается рассекретить сведения о «Блэкбрайаре» и подставить руководство ЦРУ под удар, чиновники из Министерства обороны в качестве подстраховки распоряжаются уничтожить свидетельства об экспериментах в рамках «Ауткома». Заниматься «грязной работой» поручают Эрику Байеру. Последний наведывается в тренировочный лагерь, чтобы убить Аарона как нежелательного свидетеля. Однако, напичканный стимуляторами агент ловко избегает гибели, хотя «номер третий» умирает от рук группы зачистки. Мистер Кросс осознает, что предан начальством, потому ножом выковыривает чип слежения, ловит волка и впихивает маячок в пасть хищника. Таким образом противник идет по ложному следу.