Двенадцать лет назад бывший шпион по имени Джейсон Борн смог добиться разоблачения секретной программы ЦРУ под названием «Блэкбрайар». Затем он сменил имя и род деятельности, зарабатывая участием в нелегальных схватках. Старая знакомая Никки Парсонс перебралась в исландский Рейкьявик и ведет дела с хакреской группировкой «Хактивист». Лидер организации Кристиан Дассот умудряется проникнуть в архивы Центрального разведывательного управления и выкрасть сведения о множестве незаконных операций. Никки в качестве бонуса получает данные о привлечении Борна в проект «Трэдстоун» и намеревается связаться с приятелем, поехав в Грецию. В ЦРУ узнают об атаке и руководитель отдела кибер-безопасности по имени Хэзер Ли ставит в известность директора организации Роберта Дьюи, попутно сообщив о внедрении отслеживающего вируса в файлы, добытые хакерами.
Парсонс в Афинах назначает Джейсону встречу на площади Синтагма. Там как раз проходит масштабная акция протеста, но затеряться в толпе не удается. Киллер «Спец» из ныне закрытого проекта «Блэкбрайар» убивает Никки. Впрочем, основной целью является главный герой. Ведь его стараниями в общественном доступе оказались сведения об участниках секретной программы. «Спеца» поймали и долго пытали, за что Борн должен расплатиться сполна. Полученные от Парсонс файлы содержат информацию об отце Джейсона Ричарде Уэббе, запустившем «Трэдстоун» в первоначальной вариации.