Освободив сотни собственных клонов, Элис организует стремительную атаку на подземную базу корпорации «Амбрелла», ответственной за зомби-апокалипсис. В процессе многие соратницы гибнут от огня наемников, защитных турелей и попав в ловушки. Впрочем, скорость с которой они захватывают этажи, продвигаясь вглубь сооружения, пугает председателя по имени Альберт Вескер. Последний решает от греха подальше улететь на конвертоплане. Попутно злодей активизирует мощную бомбу, которая должна уничтожить весь комплекс вместе с нападающими.

Оригинальная Элис предусмотрела подобный поворот и воспользовалась воцарившимся хаосом, чтобы тайком проникнуть в летательный аппарат и напасть на Вескера. В рукопашной схватке главная героиня терпит поражение и получает инъекцию особого препарата, подавляющего Ти-вирус, то есть лишая сверхъестественных способностей. От смерти ее спасает крушение судна, которое Альберт не успевает предотвратить. В итоге, база «Амбрелла» сгорает во всполохах взрыва, антагонист куда-то исчезает, а Элис добирается до российского аэродрома, забрав военное обмундирование и небольшой самолет модели «Як-52». Она направляется в штат Аляска, где вроде как должен находится город Аркадия, не подвергшийся атаке зомби. Оказывается, что злополучная «Амбрелла» целенаправленно распространяла ложную информацию об убежище, желая заманить доверчивых выживальщиков. Старая подруга Клэр Редфилд попала в плен к злодеям.