Капитан самых миролюбивых и славных в мире Вооруженных сил США Колтер Стивенс за время службы прошел Крым, Рим и медные трубы, а потому вывести его из себя задача совершенно непосильная. Но даже такому проверенному человеку становится не по себе, когда он, открыв глаза осознает, что находится в теле совершенно постороннего человека, а через несколько минут поезд, в котором он едет, превращается в кровавый комок железа и фрагментов человеческих тел, в результате жуткого взрыва. В следующий раз мужчина открывает глаза уже в набитой аппаратурой капсуле, а с экрана монитора очаровательная девушка в ладной военной форме сообщает, что он находится внутри специальной программы именуемой «Исходный код».

Она позволяет переместить подходящий разум в тело любого человека, и используется для предотвращения террористических актов, повлекшим многочисленные жертвы. На этот раз кандидатура Кола признается наиболее подходящей, и его целью является в течении ровно восьми минут отыскать заложенный заряд, и сообщить об этом куратору. Самостоятельно, герой ничего менять в прошлом не должен. Более того, есть информация, что этими же изуверами в центре Чикаго заложена мощнейшая «Грязная бомба», и тут речь пойдет уже о миллионах человеческих жизней. Раз за разом отправляясь назад по времени, герой пытается разобраться в происходящем, и понимает, что стал лишь пешкой в чужой игре.