После уничтожения Раккун-сити ядерным оружием прошло три года. Сначала зомби уничтожили страны Северной Америки, а затем попали на другие континенты. Наделенная сверхъестественными способностями женщина по имени Элис просыпается в недрах базы корпорации «Umbrella». Она проходит через множество комнат и коридоров, преодолевая хитроумные ловушки. В итоге, "прыгающая" мина убивает пленница, а сотрудники лаборатории под командованием Александра Айзекса выкидывают труп на поверхность, где уже лежат сотни двойников. Оказывается, в рамках специального проекта создается клон оригинальной Элис. Пока что успехи весьма скромные, что раздражает члена правления Альберта Вескера.
Сама главная героиня находится в бегах, поскольку если попадется в поле зрения военных спутников, то может потерять контроль на собой из-за особого сигнала. Спустя некоторое время Элис, с многократно возросшими суперспособностями, примыкает к группе Карлоса Оливеры и знакомится с Клэр Рэдфилд, темнокожей девушкой Бетти, Эл Джеем и снайпером Чейзом. Оснастив автомобили защитными решетками и прочими приспособлениями, эта команда действует в составе колонны. К сожалению, нападение зараженных Ти-вирусом птиц вынуждает пустить в ход огнемет, а затем и суперсилы главной героини. Спутники незамедлительно фиксируют ее местоположение и заставляют замереть. Соратники забирают с собой женщину, направившись на север, где не должно быть зомби.
Под американским городом под названием Ракун-сити крупная био-корпорация «Амбрелла» построила лабораторный комплекс «Муравейник». Недавно там произошел трагический инцидент, приведший к гибели всего персонала. Несмотря на риски, руководство решает вскрыть объект, посылая вооруженных наемников. Это приводит к утечке Ти-вируса, быстро превращающего обыкновенных людей в крайне живучих зомби. Постепенно становится очевидно, что населенный пункт не спасти и необходимо нанести удар тактической ядерной ракетой, чтобы спасти государство от эпидемии. Перед этим боссы «Амбрелла» намереваются вывести ученых, а затем провести эксперимент с новым монстром «Немесисом», выращенным путем опытов над Мэттом Эддисоном, раненным «лизуном». Прикованный к инвалидному креслу Чарльз Эшфорд узнает об инциденте, но отказывается бежать, пока сотрудники компании не заберут дочь Анжелу из школы.
К сожалению, внедорожник с девочкой попадает в аварию. Отец связывается с разными людьми в Ракун-сити, предлагая эвакуацию за спасение чада. Между тем полицейская по имени Джилл Валентайн приходит в офис спецподразделения «S.T.A.R.S.», где пытаются угомонить зомби, считая за человека. Девушка стреляет монстру в голову и объясняя ничего не подозревающим сослуживцам, что из города необходимо убегать. Единственный не перекрытый маршрут пролегает через мост под названием Рейвенс-Гейт. Впрочем, майор вооруженных сил Тимоти Кейн уже закрыл ворота.
Государственный переворот в Нигерии застал врасплох многих иностранных граждан. Правительство Соединенных Штатов начало проводить экстренную эвакуацию, а за послом отправили отряд "морских котиков". Лейтенанту Уотерсу с подчиненными удается быстро доставить чиновника на курсирующий вдоль берега авианосец под названием «Гарри Трумэн». Впрочем, на этом миссия спецназовцев не заканчивается. Где-то в глубине джунглей осталась гражданка США по имени Лена Фьори Кендрикс. Она является волонтером и до последнего времени оказывала посильную помощь бедному населению Африки, спасая от всевозможных болезней. Уотерс действует строго по проработанному в штабе плану и без особых сложностей добирается до очаровательной дамы.
Однако, по пути главный герой становится невольным свидетелем зверств, творимых повстанцами. Потому, когда очередному поселению грозит уничтожение, офицер нарушает приказ командования и берет беззащитных людей под охрану. Он намеревается добраться до границы с Камеруном, где подопечные будут в безопасности. Внезапно за Уотерсом открывают охоту нигерийские военные. Оказывается, что среди конвоируемых граждан спрятался сын свергнутого ныне президента страны. Его считают потенциальной угрозой для нового режима и намереваются устранить. Впрочем, спецназовцы демонстрируют невероятную отвагу и смекалку, ценой больших потерь доведя подопечных до пункта назначения.
Орден иллюминатов всегда ратовал за развитие науки и противостоял церкви, но с течением времени исчез. Тем не менее сторонники теории заговора продолжают считать, что организация лишь перешла в глубокое подполье, дабы не привлекая лишнее внимание реализовывать амбициозные планы. Данными заблуждениями решает воспользоваться Патрик Маккенна, которого усыновил и воспитал Папа Римский. Будучи ирландцем и яростным католиком, данный персонаж намеревается многократно усилить влияние церкви. Однако, без реальных рычагов власти подобную задумку не реализовать.
Впрочем, антагонист не лишен фантазии, потому придумывает весьма хитроумный план. Он нанимает киллера, поручив убить Понтифика, оставив символы иллюминатов на месте преступления. Встревоженные чиновники Ватикана приглашают известного ученого по имени Роберт Лэнгдон, чтобы разобраться в непростом деле. Наличие огромного количества подсказок связанных с религиозными сюжетами, историческими достопримечательностями и прочими вещами, заставляют главного героя изрядно напрячь мозги. Между тем четыре кардинала, претендующих на пост Понтифика оказываются похищены. Троих киллер убивает, а вот четвертого Роберт умудряется спасти от утопления в фонтане. Маккенна же в свете творящегося хаоса выдвигается на пост Папы Римского как и задумал. Единственный способ обычному служащему получить высокий пост, это единогласное решение совета, по "внушению свыше".
На пути в заведение, где Сэм Лоутон и другие коллеги из офиса должны пройти тренинг для укрепления взаимодействия в коллективе, автобус проезжает через подвесной мост над рекой. Главный герой отчетливо видит как канаты начинают рваться и машины падают в воду. В трагедии погибает много людей, в том числе сам молодой мужчина. Единственной выжавшей становится Молли Харпер, с которой Сэм некогда встречался. Последний уговаривает группу из достаточно доверчивых сограждан покинуть полотно моста как можно скорее. Босс по имени Деннис Лэпман один из первых следует за Лоутоном. Друзья Натан Сирс и Питер Фридкин с пассией Кэндис Хупер, тоже соглашаются уйти из транспортного средства.
Оливия Кастл вместе с Исааком Палмером тоже не хотят рисковать и в результате спасаются за секунду до катастрофы. Сотрудник Федерального бюро расследований по имени Джим Блок, которому поручено вести дело, не верит словам Сэма, считая организатором теракта. Однако, не имея весомых доказательств, агент вынужден отпустить подозреваемого, пообещав установить слежку. Через некоторое время проходит масштабные поминки бесчисленных жертв трагедии. Коронер, которого зовут Уильям Бладворт замечает уцелевших и таинственным образом намекает, что смерть свое получит и не будет мириться с хитрым трюком Лоутона. Несмотря на откровенно мистические события минувших дней, та же Кэндис игнорирует предупреждение. Она с парнем Питером идет на гимнастику.
С момента катастрофы на аттракционе «Полёт Дьявола» миновало три года. Большой любитель автогонок "NASCAR" по имени Ник О’Бэннон с возлюбленной Лори Миллиган посещает специальную арену, где проходит очередной этап состязания. Компанию паре составляют Хант Винорски и немного стервозная Джанет Каннингем. Незадолго после того как главный герой утроился на свое место, его посещает страшное видение о массовом столкновении болидов на трассе с взрывом, приводящим к обрушению целого сектора со зрителями. Ник незамедлительно начинает предупреждать окружающих об опасности. Вместе с друзьями и несколькими незнакомцами он покидает трибуны. Снаружи Надя Монрой, которую выгнали из-за неадекватной реакции кавалера, закатывает скандал.
Впрочем, договорить девушке не удается, поскольку раздается взрыв и отлетевшее колесо гоночной машины сносит голову данной особы. Вечером Картер Дэниелс, страшно расстроенный смертью благоверной, едет к жилищу темнокожего охранника по имени Джордж Лантер, чтобы установить и подпалить распятие. В итоге, автомобиль мужчина самопроизвольно начинает движение и волочит за собой хозяина. От трения горючее из банки, предназначенной для инсталляции возгорается, а огонь перекидывается на расиста. Саманта Лейн утром посещает парикмахерскую, где на голову ничего не подозревающей дамы сваливается вентилятор. Однако, чудом уцелев, последняя выходит на улицу, где в глаз прилетает камень.
Престарелый шпионы из Центрального разведывательного управления по имени Фрэнк Мозес недавно столкнулся с бывшими коллегами, а так же первоклассными наемниками, защищающими интересы коррумпированного американского политика. Благодаря исключительным профессиональным навыкам ему удалось уцелеть и вывести врага на чистую воду. Впрочем, вклад напарника Марвина Боггса недооценивать тоже не стоит. Последний во время службы обильно принимал ЛСД в рамках эксперимента и тронулся рассудком. При очередной встрече он просит главного героя помочь с одним дельцем, но безуспешно. Когда настырный собеседник пытается уехать, автомобиль взрывается. Фрэнк с возлюбленной, которую зовут Сара Росс посещает похоронную церемонию и делает вывод, что Боггс по старой привычки инсценировал собственную гибель, дабы замести следы.
Ему в голову приходит идея воткнуть иголку в руку покойника и проверить теорию. Вот только Марвин не реагирует на боль, а Мозес убеждается, что приятель действительно умер. При выходе из церкви его задерживают агенты Федерального бюро расследований и отвозят в Янки Уайт, задавая вопросы про некий проект под названием "Паслён". Главный герой отказывается давать какие-либо сведения. В этот момент агент Джек Хортон врывается в здание и без разбора расстреливает всех сотрудников, чтобы добраться до Мозеса. Ему тоже необходимы данные о "Паслёне", но церемониться со свидетелем мужчина не намерен.
В городе Кливленде, находящемся на просторах штата Огайо, проживает престарелый агент Центрального разведывательного управления в отставке по имени Фрэнк Мозес. Некогда он был одни из лучших в профессии, а ныне наслаждается покоем и умиротворенностью. Периодически главный герой ведет телефонные беседы с Сарой Росс из Канзас-Сити, чтобы скрасить одиночество, ведь жены или любовницы у мужчины нет. Однажды в дом Мозеса врываются тяжело вооруженные спецназовцы, которым явно дали задание убить пенсионера. Впрочем, последний оказывается весьма ловким и умелым бойцом и практически не пострадав, сбегает из жилище, попутно покалечив нескольких противников. Практически сразу Фрэнк задумывается о безопасности Сары.
Для него очевидно, что недавнее нападение связано с делами прошлого и кому-то захотелось избавиться от главного героя, знающего массу мрачных секретов. Хотя подобными сведениями с мисс Росс мужчина не делился, враги наверняка возьмут даму в заложники и будут пытать. Похитив Сару, Мозес отправляется к давнему знакомому по имени Марвин Боггс, параноику и лютому стороннику теорий заговора. Руководство ЦРУ дает одному из лучших агентов Уильяму Куперу приказ найти и ликвидировать главного героя. Пока он выслеживает Фрэнка, начинают всплывать неприятные для высокопоставленных чиновников факты. В 1981-ом году шпион участвовал в спасении Гэбриела Сингера из джунглей Гватемалы с шестью коллегами.
Многие государства оказались вынуждены вывести собственные дипломатические миссии из Ливии поле свержения Кадаффи, опасаясь нападения вооруженных боевиков. У Соединенных Штатов все еще остается неофициальное консульство, относительно недавно открытое в данном населенном пункте. Примерно в миле от здания по какой-то нелепой случайности находится сверхсекретная база Центрального разведывательного управления под названием «Annex». Безопасность периметра обеспечивает частная военная компания «Global Response Staff». В неспокойное время к подразделению присоединяется служивший в «Navy SEAL-s» Джек Сильва, который встречается с другом по имени Тайрон Вудс, ныне возглавляющего команду. Впоследствии главный герой знакомится с остальными сотрудниками «GRS». Среди них морпехи Марк «Оз» Гейст, Джон Тиген и Дэйв Бентон по прозвищу «Бун», а так же рейнджер Крис Паронто. Куратором выступает местный руководитель ЦРУ к которому обращаются по имени «Боб».
Последний приказывает ни при каких обстоятельствах не открывать огонь по жителям города. Дипломатическая служба безопасности США намеревается устроить визит посла в Бенгази, а Тайрон с подчиненными проверяет безопасность здания и периметра. Он совершенно откровенно говорит Скотту Уикленду и его коллеге Дэйву Уббену, что спецподразделение не в состоянии гарантировать защиту чиновника. Более того, существует повышенная вероятность неожиданной атаки со стороны боевиков.
Уже немолодой американец по имени Спенсер Петерсон живет в благоустроенном доме с супругой Лаурой, дочерью Анной и сыном Люком. Для семейства стала большой трагедией гибель старшего отпрыска Калеба, отправившегося воевать в Афганистан. Однажды на пороге оказывается некий Дэвид Коллинз, рассказывающий, будто служил вместе с упомянутым ранее бойцом и на его смертном одре дал обещание всячески помогать родне. Благодаря красноречию, дружелюбию и толике харизмы, гостю удается втереться в доверие к Петерсонам и получить возможность оставаться под крышей их дома на длительный срок. Более того, вскоре Спенсер делится с Дэвидом переживаниями, связанными с работой. В компании не все идет хорошо, а мистер Петерсон не знает как выйти из кризиса. Затем Коллинз видит синяк под глазом Люка и мстит обидчикам, избив последних в баре. Анна приглашает главного героя на молодежную вечеринку.
Там приятель Крейг дает подсказку у кого можно приобрести пистолет. Дэвид обучает Люка пользоваться подаренным раскладным ножом, на случай если нападения хулиганов продолжатся. Затем мужчина отправляется на встречу с Крейгом, знакомящим с торговцем оружием. Обоих Коллинз безжалостно убивает, взяв товар бесплатно, а вдобавок пару гранат. Совершенно случайно Анна становится свидетельницей беседы главного героя с неизвестным человеком, узнав о готовящейся пластической операции. Девушка начинает собирать сведения о таинственном госте.